BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB009G09LP1|AL426098
(813 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig1773 1581 0.0
3x_Contig1614 1565 0.0
3x_Contig1164 1502 0.0
3x_Contig894 1065 0.0
3x_Contig1790 1004 0.0
>3x_Contig1773
Length = 8694
Score = 1581 bits (797), Expect = 0.0
Identities = 810/814 (99%), Gaps = 1/814 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gatccaaagattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4083 gatccaaagattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatca 4024
Query: 61 gagtgttccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgta 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4023 gagtgttccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgta 3964
Query: 121 tctccttcggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattggga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3963 tctccttcggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattggga 3904
Query: 181 gtatataaaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3903 gtatataaaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaa 3844
Query: 241 tagcagttaatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3843 tagcagttaatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaat 3784
Query: 301 taataatctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcata 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3783 taataatctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcata 3724
Query: 361 gaatgtgacgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggag 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3723 gaatgtgacgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggag 3664
Query: 421 aggtgagcagacaaatactcgtaagccgtcaccggagg-cncccaatgccattagagtta 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 3663 aggtgagcagacaaatactcgtaagccgtcaccggaggtgccccaatgccattagagtta 3604
Query: 480 ctctcgatgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaa 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3603 ctctcgatgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaa 3544
Query: 540 macacaatggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgt 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3543 aacacaatggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgt 3484
Query: 600 ttcgtgctcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgaca 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3483 ttcgtgctcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgaca 3424
Query: 660 attggaggagccgaaccttcgtatctggaagtcaaaaacggaacctttgtccactggtca 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3423 attggaggagccgaaccttcgtatctggaagtcaaaaacggaacctttgtccactggtca 3364
Query: 720 cagcccgggtccaattgcacttccagcccttgctctccttccttttgaagcaagagtgtc 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3363 cagcccgggtccaattgcacttccagcccttgctctccttccttttgaagcaagagtgtc 3304
Query: 780 aatgcgccgtaatccgaatgaggtccaattctta 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3303 aatgcgccgtaatccgaatgaggtccaattctta 3270
>3x_Contig1614
Length = 4869
Score = 1565 bits (789), Expect = 0.0
Identities = 808/814 (99%), Gaps = 1/814 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gatccaaagattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3737 gatccaaagattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatca 3678
Query: 61 gagtgttccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgta 120
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3677 gagtgttccaataggagagagtgatataccctataactcatcagcgaatgttccgacgta 3618
Query: 121 tctccttcggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattggga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3617 tctccttcggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattggga 3558
Query: 181 gtatataaaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3557 gtatataaaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaa 3498
Query: 241 tagcagttaatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3497 tagcagttaatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaat 3438
Query: 301 taataatctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcata 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 3437 taataatctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcaaa 3378
Query: 361 gaatgtgacgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggag 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3377 gaatgtgacgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggag 3318
Query: 421 aggtgagcagacaaatactcgtaagccgtcaccggagg-cncccaatgccattagagtta 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 3317 aggtgagcagacaaatactcgtaagccgtcaccggaggtgccccaatgccattagagtta 3258
Query: 480 ctctcgatgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaa 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3257 ctctcgatgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaa 3198
Query: 540 macacaatggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgt 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3197 aacacaatggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgt 3138
Query: 600 ttcgtgctcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgaca 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3137 ttcgtgctcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgaca 3078
Query: 660 attggaggagccgaaccttcgtatctggaagtcaaaaacggaacctttgtccactggtca 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3077 attggaggagccgaaccttcgtatctggaagtcaaaaacggaacctttgtccactggtca 3018
Query: 720 cagcccgggtccaattgcacttccagcccttgctctccttccttttgaagcaagagtgtc 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3017 cagcccgggtccaattgcacttccagcccttgctctccttccttttgaagcaagagtgtc 2958
Query: 780 aatgcgccgtaatccgaatgaggtccaattctta 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2957 aatgcgccgtaatccgaatgaggtccaattctta 2924
>3x_Contig1164
Length = 2302
Score = 1502 bits (757), Expect = 0.0
Identities = 800/814 (98%), Gaps = 1/814 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gatccaaagattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1403 gatccaaagattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatca 1344
Query: 61 gagtgttccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgta 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1343 gagtgttccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgta 1284
Query: 121 tctccttcggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattggga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1283 tctccttcggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattggga 1224
Query: 181 gtatataaaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1223 gtatataaaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaa 1164
Query: 241 tagcagttaatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1163 tagcagttaatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaat 1104
Query: 301 taataatctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcata 360
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1103 taataatctcaagaaaaaaacctgtaaaacaaactgtaaaacaaaatgacagaagtcata 1044
Query: 361 gaatgtgacgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggag 420
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||
Sbjct: 1043 gaatttgacgcagcctataccatgccgtcatgcctgggaattgagctgttcacgcgggag 984
Query: 421 aggtgagcagacaaatactcgtaagccgtcaccggagg-cncccaatgccattagagtta 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct: 983 aggtgagcagacaaatactcgtaagccgtcaccggaggtgccccaatgccattcgagtta 924
Query: 480 ctctcgatgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaa 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 923 ctctcgatgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaa 864
Query: 540 macacaatggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgt 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 863 aacacaatggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgt 804
Query: 600 ttcgtgctcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgaca 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 803 ttcgtgctcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgaca 744
Query: 660 attggaggagccgaaccttcgtatctggaagtcaaaaacggaacctttgtccactggtca 719
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 743 attggaggagccgaaccttcgtatttggaagtcaaaaacggaatctttgtccactggtca 684
Query: 720 cagcccgggtccaattgcacttccagcccttgctctccttccttttgaagcaagagtgtc 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 683 cagcccgggtccaattgcacttccagcccttgctctccttccttttgaagcaagagtgtc 624
Query: 780 aatgcgccgtaatccgaatgaggtccaattctta 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 623 aatgcgccgtaatccgaatgaggtccaattctta 590
>3x_Contig894
Length = 1786
Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0
Identities = 564/570 (98%), Gaps = 3/570 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatccaaagattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1215 gatccaaagattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatca 1274
Query: 61 gagtgttccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgta 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1275 gagtgttccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgta 1334
Query: 121 tctccttcggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattggga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1335 tctccttcggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattggga 1394
Query: 181 gtatataaaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1395 gtatataaaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaa 1454
Query: 241 tagcagttaatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1455 tagcagttaatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaat 1514
Query: 301 taataatctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcata 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1515 taataatctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcata 1574
Query: 361 gaatgtgacgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggag 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1575 gaatgtgacgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggag 1634
Query: 421 aggtgagcagacaaatactcgtaagccgtcaccggagg-cncccaatgccattagagtta 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 1635 aggtgagcagacaaatactcgtaagccgtcaccggaggtgccccaatgccattagagtta 1694
Query: 480 ctctcgatgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaa 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1695 ctctcgatgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaa 1754
Query: 540 maca-caatggagtatctgtc-actggatc 567
||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1755 aacaccaatggagtatctgtctactggatc 1784
>3x_Contig1790
Length = 27369
Score = 1004 bits (506), Expect = 0.0
Identities = 518/521 (99%), Gaps = 1/521 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gatccaaagattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 526 gatccaaagattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatca 467
Query: 61 gagtgttccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgta 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 466 gagtgttccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgta 407
Query: 121 tctccttcggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattggga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 406 tctccttcggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattggga 347
Query: 181 gtatataaaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346 gtatataaaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaa 287
Query: 241 tagcagttaatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 286 tagcagttaatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaat 227
Query: 301 taataatctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcata 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 226 taataatctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcata 167
Query: 361 gaatgtgacgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggag 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 166 gaatgtgacgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggag 107
Query: 421 aggtgagcagacaaatactcgtaagccgtcaccggagg-cncccaatgccattagagtta 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 106 aggtgagcagacaaatactcgtaagccgtcaccggaggtgccccaatgccattagagtta 47
Query: 480 ctctcgatgactctacttggaacgggatctagggtagtgtc 520
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 46 ctctcgatgactctacttggaacgggatctagggtagtgtc 6
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 6211
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 6211
Number of successful extensions: 55
Number of sequences better than 1.0e-20: 5
length of query: 813
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 797
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 8232722283
effective search space used: 8232722283
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.7 bits)